最後一話的標題是——《我最好的朋友》。
「小焰，對不起。我要成為魔法少女。」小圓微笑著，這樣說道。
在第11話《最後留下的路標》之中，沙耶香的葬禮在雨中肅穆進行。QB出現在獨自悲傷的小圓面前，以平淡的語氣述說沙耶香她們的死，小圓對此感到憤怒。無法理解圓這種情緒的丘比，說出孵化者與人類共度至今的歷史。
「我終於明白了，終於找到想實現的心愿了。所以，我要為此使用我的生命。」小圓十分溫柔地訴說著，似乎她已經完全不懼那悲慘的命運。
然而在《魔法少女小圓》之中，學姐三話掉頭，就奠定了這樣一個特別殘酷的基調，之後的各種展開，也就顯得十分尋常了。
曉美焰因為知道魔法少女的殘酷命運，所以一直在阻止小圓成為魔法少女，所以當小圓表示，她還是要成為魔法少女時，曉美焰感覺特別難受。hetubook.com.com
倒數第二話結束之後，小圓到底選不選擇成為魔法少女，她的願望到底是什麼，這樣的懸念則留到了最後一話之中。
小圓終於許願了，她說：「想把所有的魔女在誕生之前消滅，所有的宇宙，過去和未來所有的魔女，由我親手……」
總而言之，這樣一部魔法少女題材作品，已經完全搞出了不同於其他同題材的深度，甚至對其他同題材的作品衝擊性特別大，因為在這之前，很少有這種題材的作品，去探討魔法少女是如何誕生的，也不會試著用科學去解釋這一切……
再熱鬧的事情，隨著時間的推移，也會漸漸平息，何況對大多數粉絲來說，無論是安大理事長還是安安老師，對他們來說，距離都太遠了，他們之間到底是什麼關係，最多也就成為他們一個八卦的談資而已。
這種設定一出現，讓不少漫迷都m.ｈｅtubｏoｋ•ｃｏｍ.com
大開眼界，實在是高大上啊！一部魔法少女題材的作品，這一點也不「魔法」啊，反而非常物理！
「不要！那樣的話，那樣的話，我……是為了什麼……」曉美焰用近乎哀求的語氣說著，她痛哭了起來。
因為每個魔法少女生前的能力和經歷不同，每個魔女的形象、能力、結界內置都各成一家，並且也存在大量物象來暗示這個魔女生前的經歷。例如沙耶香變成的人魚騎士，其實人魚騎士的形象暗示其生前的魔法少女形象和能力，人魚象徵悲戀，不斷演奏的弦樂象徵她未能實現的愛情，時常展示的伸臂求擁抱手勢象徵她生前寂寞。
安憶看到自家哥哥臉黑，她就笑了，她有時覺得，她的眾多粉絲，還是相當有趣的，特別會玩梗會開玩笑。
當《魔法少女小圓》最後一話播出時，眾多忠實粉絲，已經開始第一時間在N站追番。
然和-圖-書後QB就傻眼了，它說這個願望實現了的話，那可不僅是時間干涉的等級了，是對因果律本身的反逆，你真的打算成為神嗎？
這樣的設定，對大部分觀眾來說，自然也感覺特別緻郁，實在是因為，在這部顛覆性的魔法少女題材的作品之中，魔法少女們的命運，真的太殘酷了，明明她們都是那樣可愛的美少女們啊，在其他魔法少女題材的作品中，怎麼可能會出現魔法少女這樣的「主角」，被打敗被發便當這種事情？
許多習慣了在N站追番的，再看電視上播出的動畫的話，總覺得沒有彈幕，就特別沒意思，這一邊追番一邊看彈幕，才會有一種許多人同時一起看番的感覺……
但是，《魔法少女小圓》卻做到了，還搞得有模有樣，明顯可以自圓其說，以至於都有這部作品的忠實粉絲，大讚這其實是一部科幻作品，那些魔法少女，實際上也是強大文明的產物。和-圖-書
還有當然就是「反派」魔女的設定了，原來她們竟然是魔法少女們的最終歸宿。因為希望轉變為絕望而墮入內心的黑暗，或者靈核沒有來得及凈化，都會導致魔法少女轉變為魔女。魔女躲在自己的結界中，到處散播絕望。普通人類看不到魔女。
小圓沒有任何猶豫，堅定地許願了！
有安立正面回應了一切，她也就懶得再在圍脖中回應了，她反正覺得，自己和哥哥的關係暴露，也沒什麼大不了的，安立以她為自己的驕傲，她何嘗不為自己有安立這樣的好哥哥而自豪？
然後QB對小圓表示：「包含了無數世界的命運，成為因果的特異點的你的話，多麼巨大的願望，都可以實現……那麼，鹿目圓，以你的靈魂作為代價，你有什麼願望？」
「對不起，真的很對不起。我在想，一直以來，一直一直被小焰守護著，期望著，才有現在的我，正是這樣的我，終於找到了答和-圖-書案，相信我吧，絕不會讓小焰到今天為止的努力白費。」小圓這樣安慰對方。
而現在最受二次元漫迷們關注的，正是《魔法少女小圓》這部作品，已經接近了尾聲，許多粉絲期待的大結局，終於來了！
額頭還在流血的曉美焰，難以置信地回應道：「小圓……怎麼會。」
這倒數第二話的內容，基本上就已經將這一部特別具有顛覆性的魔法少女題材作品的設定，完全抖出來了，比如說孵化者，正是宇宙中擁有古老文明的種族，見證了人類從原始社會發展至今的文明。除極少數個體外不存在感情，擁有能將感情轉化為能量的技術。為了滿足宇宙無數種族的能量消耗、避免整個宇宙陷入熱寂的狀態而尋找能源，后發現人類的感情轉化而來的能量竟能凌駕于熵，於是決定犧牲人類個體的一小部分來為全宇宙提供能量。與擁有資質的少女簽訂契約，實現少女的願望並令其成為魔法少女。