一開始，黃巢對於齊軍劫掠長安是默許的，因為他不得不如此。原本，黃巢的吏部尚書張言曾經上奏過一道奏章，也提到了此時齊軍入長安之後的困境。但張言提出，不可放縱軍士劫掠。就算不得已要，也應當是由大齊朝廷出面，組織正式的行動，由朝廷出面抄沒原李唐皇族和皇親國戚與高官貴族們的產業錢糧以充公，不可由將士們私下劫掠。因為讓將士們私下劫掠，不但會使得本來就不強的齊軍軍紀更加惡化，而且就算是搶到的錢糧，也大部份被一些將士私藏，根本無法更好的為朝廷所用。
除了秦軍特勤司的秘密據點，也有許多官員和貴族們也有自己的秘密藏身之地，但這些據點很多都被發現，躲藏的人全都被憤怒的黃巢處死。
只是黃巢的這個進一步退讓，依然熱臉貼了冷屁股。此時的原唐朝官員，畏黃巢如虎，哪個敢以身伴虎。
「順有者昌，逆我者亡，凡敢抗拒不從者，皆殺之！」黃巢提著滴血長劍，咬牙切齒怒吼咆哮道。
關中三十萬大軍，加上投降的唐軍有近十萬，還有河南留守的有二十萬人馬，加起來。黃巢現在光是軍隊供養就有六十萬人，哪怕真正能打的也許只有三分之一四分之一，可這些人吃起飯來，卻是不可能只吃三分之一四分之一的。
剛入長安時，黃巢心中高興之餘，想的是要以自己心中的才華，好好的打理他的大齊。長安，會成為大齊的國都，他會善待這裏的士族百姓，讓他們都跟隨於他，建立一個萬古長存的帝國。可這種遠大抱負，僅僅三天就終結了。
齊軍的一輪搶劫，長安城有十分之一毀為灰燼，十
hetubook.com.com萬以上百姓喪于兵亂。
慢慢吟誦起當年不第離開長安時的這首詩，那個時候，他心中激憤萬分。沒想到，這麼多年後，他竟然真的再回到了長安，而且是帶著數十萬大軍，衝天香陣透長安，滿城盡帶黃金甲。到現在，他還能記起再回長安時心中的激昂。
黃巢進入長安之後，李璟轉眼就控制了淮泗，奪取徐濠宿豪壽楚諸州，把河南留守的軍隊壓縮在洛陽附近。而東南的各藩鎮，早已經中斷了對關中的供應。
「待到秋來九月八，我花開后百花殺。衝天香陣透長安，滿城盡帶黃金甲。」
李璟派出的軍情司積極的和齊軍搶人，盡量的搜尋搭救那些官員和士人等。
大明宮飛閣之上，頭頂皇冠，身穿龍袍的黃巢顯得有些疲憊，並沒有成為大齊帝王之後的應有的喜悅。憑欄遠眺，黃巢的眉間卻緊皺著，目光中透著深深的憂愁。
只是數月過去，現在黃巢心裏已經沒有了半點當初的高興。
長安。
齊軍入長安城的一通燒殺劫掠，徹底的讓那些名門高族。士族大戶，甚至是土豪地主們，全都對黃巢冷目以對，憎恨不已。對於他們來說，這樣的一支齊軍。這樣的黃巢，就算佔了東都西京又如何，就算黃巢穿上了皇袍，可也不過是一沐猴而冠的小丑而已。
可結果卻是，除了那幾十隻小貓小狗外，長安城中的官員們，要麼早就跟著天子逃了，要麼就是後來跑了。就是沒跑的，要麼被李璟派出的特工接走了，要麼就是各自躲藏起來了。
在長安城中，除了大慈恩寺地宮中隱藏的相國於琮和廣德公主和_圖_書
外，還有身份顯赫的宰相豆盧瑑、崔沆等。在長安城中和城外，秦軍軍情司有十幾個秘密據點，在這些地方避難的人，有數千人之眾，幾乎都是那些名門大族，朝廷官員，皇親國戚。
終於，憤怒之下，黃巢下了第三道聖旨，所有敢躲藏逃亡的公卿大臣，一旦發現，立即就地格殺。所有已經被抓獲的李唐宗室，殺！所有看不起他黃巢和大齊，拒絕出仕新朝的士人，通通殺！
他帶來了三十萬大軍，以及將近二十萬的隨軍將士家眷，可只帶了大軍不到一月的糧草。可城中還剩下了近五十萬人口，他接收了長安，也一下子接收了五十萬張等待吃飯的大嘴。
大唐官員，一二品官位基本上是虛銜，真正辦事的多是從三品算起。黃巢的這道旨意，本意是把那些尊榮的李唐年老退休重臣外，其餘的官員實際上都是保留原職。而且。若是表現的好，就算是三品以上的，如張直方就留任並加官了。
連當年德宗父子都如此窘境，可知現在黃巢的處境更艱難。
太子少師裴諗、御史中丞趙蒙、刑部侍郎李溥、京兆尹李湯等大批官員，還有未能逃出城的李唐宗親們，一批批被從民間搜捕到，隨後一個個身首異處，屍骨狼籍於市，血染街頭。連長安陷落前自殺而死的前宰相盧攜的屍體都被棺材中拖了出來，在集市上梟首示眾！
在德宗貞元年間，由於四王二帝之亂，關中各糧倉告竭，禁軍都騷動不安。德宗每天東望糧船，心焦不已。後來終於得知江淮的漕糧運至陝州時，唐德宗李適竟對著太子李誦喜極而泣道：「我們父子說算又能活命了！」
「天下英雄，入和圖書吾彀中。」黃巢心裏美滋滋的想著。
長安居於關中，原本以物產豐饒著稱，可由於關中天下中心的地位。人口增長不斷，關中有大量人口眾多的城池，關中糧食早已不能自給，不再是秦漢時代那個千里沃野的大糧倉了，這座帝都的錦秀繁華。必須建立東南藩鎮源源不斷地輸血之上。從唐中期開始，平均每年需要從江淮運送漕糧約二百五十萬石到長安，以供駐京城的中央禁軍、百官士民所需。
更加糟糕的是，當黃巢下旨宣原長安城中李唐官員，三品雙上革職，四品及以下者，全部留任，並立即繼續到衙辦公之時。結果只有當初前往灞上迎接他的張直方那幾十隻小貓小狗。
不過當時黃巢思忖一會後拒絕了，他沒說理由，但張言猜測黃巢是不願意把搶劫這件事情做為自己的主意，不願意背這個惡名，留于史書。
長安，這座繁華的都城，卻更似一座沉重的枷鎖，一座巨大的牢籠，把他和他麾下的齊軍將士給鎖在了這裏。這是一座巨大的泥潭，他的將士們都陷進去了。
面對齊軍各部縱兵搶掠長安，黃巢只能是默許。因為如果不允許，他卻拿不出糧食來供給安撫軍心。
那兩個姓鄭的，被搜出來后，黃巢親自賜下諸多賞賜，可最後居然換來一個寧可全家自殺也不肯做他臣子的結果。
最讓黃巢憤怒出離的是，原將作監鄭鄭綦、庫部郞中鄭系兩個大臣被齊軍發現之後，這兩個一個三品高官一個五品官員都堅決不肯做黃巢的臣子，不但如此，兩人甚至直接全家自殺。
因此，當黃巢回過頭來，意識到光靠他那幾十萬打打殺殺，搶劫殺人的將士治不了大和圖書齊天下，想要啟用唐朝官員時，從者寥寥。不但那些官員如此，就是那些沒有官身的士人，對於他的招賢榜也完全沒有興趣。
歸附的諸鎮現在也還只是名義上的歸附，錢糧等都是他們自給自足，就算是上交的上供，也只是杯水車薪而已。
表面上。黃巢先下洛陽，後下長安，外表輝煌萬分，聲勢動于天下。但若從根本上看，其數十萬大軍的暗底下，卻是比之當年德宗還要糟糕百倍的經濟民生情況。雖然黃巢如今佔據數十州之地，並且已經有數個藩鎮表示臣服黃巢，但關健的是黃巢所處的這些地方，都是反覆拉鋸之後的戰後之地，原先在洛陽時。還得到不少存糧。但進入長安之後，卻是一座空城。
這件事情深深的傷害了黃巢的自尊心，當年他屢次入長安科舉，結果長安的貴族名門都看不起他這個鄉下舉子。而如今他已經貴為天子了，這些人居然還是如此藐視他。
安史之亂后，河南和河東這兩大產糧區，所產出糧食，卻幾乎用於中原諸藩鎮。用以供養遏制河北藩鎮的各鎮。長安所需缺糧食，便反而需要依靠更遠的東南的江淮地區，靠這裏的財源型藩鎮的糧食供給長安。如果是在正常的情況下，長安依靠發達的漕運和商貿系統，也能夠彌補維持本地的產糧不足。可關健的是這是一個極為脆落的平衡。一旦有意外發生，導致漕運不暢。那麼長安就很快會發生糧荒。
前淮南節度使劉鄴被搜出，黃巢許諾，只要劉鄴歸順，就讓他做同平章事。結果曾經當過宰相，又出任過多地藩鎮節帥，有著貪婪名聲的劉鄴卻也毫不猶豫的拒絕了，氣的黃巢親自拔劍斬殺了劉鄴和_圖_書。
原先唐朝廷中央依靠的東南藩鎮已經中斷供應，而河南的糧食也多被帶到關中，剩下的勉強維持河南的齊軍，根本不可能再向關中供應。
這些原本留下沒走的官員，還想著就算改朝換代，他們這些人也可以繼續做官。可是在見到了齊軍的暴行之後，哪個還敢出來？他們的府第宅院莊園，全都已經被齊軍將領們霸佔著。跑的慢點的，甚至早就被亂軍給殺了。
長安居然是一座空城，沒有糧食。
上一次，齊軍劫掠長安，主要以搶奪宅子錢財女人為主，對於那些官員大族，如果配合交出財產，或者逃離的，他們並不追究。可這一次，全長安城展開了大緝捕行動，如狼似虎的齊軍闖進長安城的每一個坊、里，沖入每一條街道，張顯著他們的野蠻與殘暴。
黃巢下這道聖旨的時候，心裏還想著，他如此的大方，天恩隆重。那些官員豈不還都爭相來投。
這樣的情況下，除了搶，他還能怎麼辦？
沒有人願意給黃巢當官，可新建的大齊帝國不可能靠一群只會打打殺殺的兵頭們治理。於是，不久之後，黃巢又下了一道新的聖旨，凡是原唐朝官員，也不論品級，只要帶上貼子，到大齊侍中兼同平章事趙璋的府第報道，就一律恢復他們的官職。
愛惜面子的結果就是，齊軍入長安三天之後就從搶佔宅子開始，到最後上到將軍下到士卒，到處搶劫，並且到最後徹底的失去軍紀約束，殺人放火，搶劫姦淫，甚至是齊軍之間也是鬥毆火併不斷，巨大的長安城，完全是一片糟糕。等到黃巢終於感覺不對勁想要約束軍紀時，已經來不及了。
詔書張榜貼出去好幾天，根本就沒幾個人前來。