黃得功、周遇吉二人也是勃然大怒，二人也跪倒在地，紛紛請戰。
朱由檢又溫言安撫幾句，待眾人起身情緒逐漸平靜下來后，繼續開口道：「此事朕考慮良久，既要懲一儆百，又不能引起兵變。周遇吉、黃得功二位將軍，你們帶領五百勇衛營精騎秘密前往單縣，找一處隱秘之處駐紮。朕會下密旨給山東巡撫，讓其親自到單縣，召見吳尚文，吳賊肯定不虞有詐。你們事先探查好地形，在吳賊必經之路截殺之，務使一人走脫。誅殺此賊后，朕會讓山東巡撫攜旨與你二人一同前往兵營，安撫官兵，你二人以後就留在山東。首先裁汰軍營里的老弱，適當給其銀兩，放還回家；其二是就地募兵。山東乃聖人故地，民風淳樸，山東兵忠誠可靠，這次吳賊一事，應是其蠱惑眾人所致。朕會著有司運送十萬兩兵餉給你們，同時新式軍糧也會後續送達。加上原先吳賊的部下官軍，朕要求你們募集五千兵馬，勤加操練，爭取儘快成為一隻敢打敢拼的精兵。你們帶去的五百精騎就作為親兵標營，希望你們不負朕之所託。一會朕會讓內閣擬旨，晉孫應元將軍為勇衛營總兵官，朕會下旨給提督京營的成國公，著你從京營中挑選敢戰之士補充勇衛營。晉黃得功將軍為山東副總兵；晉周遇吉將軍為參將；等將來你們立功后再行升賞。」
崇禎坐回到御案后，開始考慮到底如何解決欽差被攔，侍衛被殺一事。
朱大典趕忙命齊大同帶幾名校尉下去歇息，囑咐好生款待眾人，齊大同與幾名校尉行禮后離去。
幾名錦衣衛還禮后，其中一人從懷裡掏出一個硃紅色的匣子，朱大典急忙要跪下接旨，拿聖旨那名校尉攔阻道：「巡撫大人，聖上特意吩咐過，此為密旨，大人不必行大禮，只需按旨行事便可！」
眾臣退下回內閣擬旨，朱由檢繼續等待勇衛營將官的到來，畢竟內閣辦公處離武英殿很近，而勇衛營則在宮城之外，一來一回需要時間。
崇禎來回走了幾趟後站住身形，開口道：「劉朝你回去繼續辦差！李二喜你立刻去勇衛營召孫應元、周遇吉、黃得功https://www.hetubook.com.com覲見，王承恩你派人去內閣召集閣臣前來議事！」，幾人紛紛領命而去。
這導致了武將日益驕橫，並逐漸對朝廷的號令陽奉陰違。處處以自己團體和個人利益為重，如果這種情況持續下去，就算是能剿滅賊寇，也會形成尾大不掉的局面。朝廷徹底失去對武將的掌控，後果不堪設想。
朱大典站直身形，雙手鄭重接過木匣，那名校尉繼續說道：「聖上還囑咐過，此旨只有巡撫大人自知，旁人不可知曉，還請大人謹慎行事。傳旨之事已了，還請大人安排個住處，我等兄弟歇息一晚，明早回京復旨。」
這次文臣們不管是何黨派，意見出奇的一致，這是赤|裸裸的蔑視朝廷，蔑視朝廷就是蔑視文官。幾乎所有官員都是義憤填膺，紛紛上奏摺表達憤慨之意，要求朝廷懲治不法，以正綱紀。
諸將聽完，先是震驚，然後是滔天怒火。孫應元噗通跪倒，不顧禮儀，直視著皇帝，臉色通紅，鬚髮皆張，大聲道：「陛下，臣等身為大明武將，皇家親衛，蒙陛下撿拔于寒末，深感君恩！今有屑小竟敢行如此逆天之事，致使欽差受辱，主辱臣死！陛下，臣願攜虎賁之師討此逆賊，定將此賊項上人頭斬下，以雪此恥！」說完，以頭觸地，俯身不起。
紫禁城武英殿內，朱由檢正在聽取劉朝關於皇莊事物的彙報。
他雖是貴為封疆大吏，名義上山東境內兵馬都在他所轄之下，但現在世道混亂，朝廷對武將倚重甚深，那些手下有兵的兵頭日益跋扈。
朱由檢繼續道：「不單是此事，朕聽聞百姓苦於官兵甚於賊寇。許多官軍騷擾地方，搶掠百姓，甚至殺人奪財，可見現今軍紀是如何的敗壞，這還是朝廷的兵馬嗎？實于流賊無異！溫卿，你回內閣后給各地督撫總兵擬旨，嚴明號令，以後凡兵丁擾害地方與百姓者，殺無赦！凡將官能約束部下秋毫無犯者破格拔擢。此旨與朕前番所言陣亡傷殘官兵之待遇一同頒發，你等退下吧！」
「大人，前來傳旨的錦衣衛說了，是給大人的密旨，外人不得與知！」hetubook.com.com，齊大同回道。
溫體仁等一眾閣老也是意見統一，正準備一起進宮面聖，傳旨的太監帶來了皇帝召集議事的口諭，眾人隨同傳旨的太監一起來到了武英殿。
朱大典一愣，迅即明白過來，這應該是朝廷對欽差一事的處置下來了，沒想到如此之快。同時心裏還有一絲疑惑，為何是錦衣衛傳旨，並且還是密旨，這種事不都是聖旨明發嗎？雖然有點疑惑，但他還是站起身來，吩咐道：「速擺香案，迎旨！」。
「那快快有請上差！」，他開口道。
朱大典又是一愣，難道自己猜錯了？這個關頭聖上單獨給自己密旨是何原由？
他的前身崇禎皇帝對文臣毫不手軟。上至閣老督撫，下至知州知縣，一旦有違聖意或是觸犯到皇帝的逆鱗，不是被抓被免就是被殺。其中最有名的就是袁崇煥，被凌遲處死。很多人為其鳴不平，甚至在崇禎後世那個時代，關於袁崇煥的爭議從未停止過。
此時，欽差被索要過路銀一事已在京城裡傳的沸沸揚揚。
孫應元三人激動的痛哭流涕，紛紛跪倒，誓言不惜此身，定要讓陛下得償所願。
看完內容簡單的密旨后，朱大典既震驚又振奮，這還是他所了解的聖上嗎？聖上密旨里所講和所要做的，都是他朱大典所想所為，可他也只是憤慨之下想想而已，但他根本沒權利去做。
閣臣們詫異相顧，這還是自己認識的皇帝嗎？怎麼突然對武將也硬氣起來了？但是這做法其實非常符合文臣們的心意，暗喜之下，眾人齊齊躬身道：「謹遵聖喻！」
正在這時，李二喜手裡拿著一本奏疏急匆匆邁進殿內，王承恩趕忙上前接過後呈給崇禎，崇禎接過奏疏后掃視幾眼，猛地把奏疏摔向地面，站起身繞過書案後背著手在殿內來回走動，臉色鐵青。
朱由檢讚許的點點頭，表揚道：「做的不錯！朕看的出你是實心做事，好好做下去，朕不會虧待你！你回去后著人探訪周邊莊子里會打井的匠人。今春夏雨量極少，要有備無患，預防以後長期乾旱。打井的匠人多多益善，尋著后每個匠人帶一隊青壯，先在莊裡開和圖書始打井，所需費用按市價結算。這一點一定要注意，朕打算培養專業打井隊伍，要讓打井隊掙錢，只有掙錢才能調動起積極性。打井隊要逐漸擴大規模，莊裡的青壯要充分利用起來，先在皇莊田地里打一百口，等積累起經驗再向周邊地區擴展。還有上次查抄誠意伯的田莊，你要帶人儘快接手，多培養幾個得力手下，不然你一個根本忙不過來，如有需要儘管與王承恩分說！」
接旨前他心裏也曾隱隱的埋怨過皇帝和朝廷大佬們，因為他以為皇帝這次又要對武將優柔，沒想到聖上這次一改前風，終於對那些蔑視朝廷的兵頭痛下殺手。真是痛快啊！想到這裏，朱大典笑了起來，笑聲越來越大，長久不息。
朱由檢開口道：「那眾卿意欲如何？」
因為王昺的奏疏走的是通政司——內閣——皇帝這道程序，所以很快被傳了出去。
他深深的嘆了一口氣，端起茶水抿了一口，正要放下茶杯，幕僚齊大同急匆匆邁步入內，拱手心裏后說道：「大人，有京城錦衣衛攜聖上密旨來到，現在堂外值房用茶！」。
朱由檢搖了搖頭道：「此事前所未有，如果不以嚴懲，怕會群起效仿，朝廷的政令將會被視若無物。朕不信少了一個游擊及其部眾，會影響到剿賊大事，就依照律法來吧，殺人者償命，無視朝廷者誅之！」
濟南，大明湖畔巡撫衙門二堂內，山東巡撫朱大典正在為吳尚文部攔阻欽差一事愁眉不展。
但崇禎對於武將卻格外寬容，這也是無奈之舉。天下動蕩，內憂外患，需要依仗武將來掃蕩賊寇，以前大明文貴武賤的現象已經徹底反轉。對於武將的錯誤崇禎是一忍再忍，頂多下旨呵斥，但未見有任何實際的處罰。
眾人離去后，朱大典驗看過木匣上的蠟封完好，然後引燃蠟燭化開蠟封后打開木匣，拿出皇帝的密旨觀看。
以他對當今聖上所作所為的了解，這次的事恐怕也是雷聲大雨點小，頂多是下旨申飭而已。
劉朝應下后稟道：「皇爺，奴婢所知，打一口井的費用可是不小，如果按照市價結算，僅咱們庄就需數千兩銀子，將來要是再去其和*圖*書他農莊打井，恐怕一般的農戶負擔不起啊！」
這次吳尚文部所為讓朱大典憤怒異常，作為朝廷重臣，他感到深深的恥辱，並且有一種濃重的挫敗感。這種公然讓朝廷蒙羞的事情以前是絕不可能發生的，可事已如此，他也無能為力，只能坐等皇上與朝廷對此事的處置。
想到這裏，朱由檢拿定主意，這次一定要殺一儆百，要用強有力的回擊來震懾那些跋扈之人。
齊大同出門后沒一會兒就返身而回，身後跟著幾名身著校尉服色風塵僕僕的錦衣衛。
自大明建國以來，這樣的事從未出現過。
朱由檢起身繞過御案來到三人面前，親手一一將諸人扶起。在孫應元等人心裏，崇禎就是君父，當下感動的熱淚盈眶。朱由檢看著三人，溫聲說道：「朕深知眾卿皆是忠貞之士，勇衛營是朕最信得過的隊伍，也是朕之依仗！朕希望有一天，卿等能率部下虎賁為朕掃蕩群小，還大明一個朗朗乾坤！朕不會說以王侯待之，但朕會將你們以家人待之，這就是朕給你們的許諾！卿等不負朕，朕絕不負卿！」
朱大典趕緊拱手為禮，開口道：「幾位上差一路辛苦！」
又過了一刻鐘左右，李二喜帶著孫應元諸人匆忙趕來，進殿後，諸將大禮參拜。朱由檢吩咐起身，神色嚴肅的看著諸人，把欽差一事說了出來。
王承恩等人嚇得縮在一邊大氣不敢出。
這番建議其實是溫體仁等人順著原先崇禎的思路想出來的，卻不知現在的崇禎已非原先那位。
三人跪地叩謝聖恩后領旨而去。黃得功、周遇吉回勇衛營點齊五百精騎出京師直奔山東，攜帶皇帝密旨的一隊錦衣衛緹騎也連夜趕往濟南府。
以前總兵見他都要行磕頭大禮，現在山東總兵劉澤清等眾武將見了他也只拱手為禮，山東總兵一下官軍根本不會聽命與他，對此他雖氣憤但也無可奈何。
眾人對皇帝行禮之後，溫體仁率先出列奏道：「陛下，這次欽差被攔阻一事在京師已是掀起莫大|波瀾，如果處置不當，那朝廷威儀和臉面盡失，並且恐怕有其他武將效仿。至此國亂之際，後果不堪設想，臣等力主嚴懲，具體如何還請聖上裁hetubook.com.com定！」
朱由檢開口道：「以後如果給普通農莊打井，所需費用由朝廷負擔。如果是其他勛貴富戶需要，要按照市價結算。劉朝，你可知由陝西而起的賊寇原先都是普通農戶嗎？就是由於陝西連年大旱，田地里連續顆粒無收，餓死百姓無數。所以在某些別有用心之人蠱惑下，這些農戶抱著怎麼也是死，與其餓死，不如搶掠別人，吃一頓飽飯再死的想法才造反。如今旱情繼續擴大，朕不想在天子腳下的京師，也出現如此情形。只要田地里有產出，百姓不憂飢餓，是絕不會與朝廷為敵的，所以打井花多少錢都值。有井水灌溉，即使大旱，糧食也不會絕收。到時朝廷再減免賦稅，加強救濟，百姓就能渡過飢荒，大明才不會四處生亂。朕準備把這項工程推及受旱嚴重的幾個省，朕為天子，不能看著自己的子民受餓而死，否則，朕無顏面對天下蒼生！」
「啟稟皇爺，自打上次皇爺駕臨皇莊后，奴婢等人加緊安排生產。因飯食管飽，皇爺又減免佃租，分發雞鴨豬種苗，莊裡百姓幹勁十足。不管是青壯還是老弱婦孺，但凡有勞力者都是勤勉做活。奴婢不知道如何形容，只覺得百姓們從心裡頭透著高興，人人都是精神百倍。時至昨日，莊裡圍牆基本建成；工坊都已開始使用，軍糧已經產出了一萬余石，在工部官員教導下，軍服產出也已逐漸正規，現已產出軍服兩百余套。這主要是縫製的婦人們開始不夠熟練的原因，隨著婦人縫製手藝越來越好，產出會越來越高。雞鴨日常都是村裡孩童照料，別看孩子們小，但做事異常用心，至於何時開始產蛋，奴婢不太懂的。至於養豬的也都勤勉異常，這些農戶聽說雞鴨豬產出后都有莊裡收購，人人稱頌聖君在世，有的還要給皇爺您立生祠，奴婢沒答應。莊裡事就是這些，奴婢還要請示，下一步青壯基本無事可做，該要如何還請皇爺示下！」
閣老們互相看了一眼，都知道自己這位陛下這幾年嚴待文臣，寬容武將，遲疑了一下，還是溫體仁奏道：「臣等剛才略微商議一番，應下旨申飭山東巡撫和總兵，將肇事者降級撤職，調往他處！」