基地紀元四九八年，兩名基地公民登上最先進的太空艇，準備進行一次極不尋常的銀河之旅。表面上，他們將尋找傳說中的人類原鄉，實際的任務，則是要證明第二基地依舊存在。

與此同時，銀河中又出現一個神秘的第三勢力。他們行事神出鬼沒，法力廣大無邊，甚至連預示銀河未來命運的謝頓計畫，似乎也在這個組織掌握之中。到底是由於機緣巧合，還是經過精心的安排，兩個基地與神秘的第三勢力，最後竟然在一顆稱為蓋婭的行星交會！銀河未來終極的命運，即將在他們眼前揭示……